• Humanistinen tiedekunta
  • Humanistisen tiedekunnan kanslia
  • Filosofian, historian, kulttuurin ja taiteiden tutkimuksen laitos
  • Maailman kulttuurien laitos
  • Nykykielten laitos
  • Suomen kielen, suomalais-ugrilaisten ja pohjoismaisten kielten ja kirjallisuuksien laitos

• Käyttäytymistieteellinen tiedekunta
  • Käyttäytymistieteellisen tiedekunnan kanslia
  • Käyttäytymistieteiden laitos
  • Opettajankoulutuslaitos

• Oikeustieteellinen tiedekunta
  • Oikeustieteellisen tiedekunnan kanslia

• Teologinen tiedekunta
  • Teologisen tiedekunnan kanslia

• Valtiotieteellinen tiedekunta
  • Valtiotieteellisen tiedekunnan kanslia
  • Politiikan ja talouden tutkimuksen laitos
  • Sosiaalitieteiden laitos

• Svenska social- och kommunalhögskolan
  • Svenska social- och kommunalhögskolan: kanslia

• Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta
  • Matemaattis-luonnontieteellisen tiedekunnan kanslia
  • Fysiikan laitos
  • Geotieteiden ja maantieteen laitos
  • Seismologian instituutti
  • Kemian laitos
  • Kemiallisen aseen kieltosopimuksen instituutti (VERIFIN)
  • Matematiikan ja tilastotieteen laitos
  • Tietojenkäsittelytieteen laitos

• Lääketieteellinen tiedekunta
  • Lääketieteellisen tiedekunnan kanslia
  • Biolääketieteen laitos
  • Hammaslääketieteen laitos
  • Kliininen laitos
  • Kliinisteoreettinen laitos (Haartman-instituutti)
  • Hjelt-instituutti (Kansanterveystieteen osasto)
  • Hjelt-instituutti (Oikeuslääketieteen osasto)

• Bio- ja ympäristötieteellinen tiedekunta
  • Bio- ja ympäristötieteellisen tiedekunnan kanslia
  • Biotieteiden laitos
  • Ympäristötieteiden laitos (Viikki)
  • Ympäristötieteiden laitos (Lahti)
  • Lammin biologinen asema
  • Tvärminnen eläintieteellinen asema
  • Kilpisjärven biologinen asema

• Eläinlääketieteellinen tiedekunta
  • Eläinlääketieteellisen tiedekunnan kanslia
  • Yliopistollinen eläinsairaala

• Farmasian tiedekunta
  • Farmasian tiedekunnan kanslia

• Maatalous-metsätieteellinen tiedekunta
  • Maatalous-metsätieteellisen tiedekunnan kanslia
  • Elintarvike- ja ympäristötieteiden laitos
  • Maataloustieteiden laitos
  • Metsätieteiden laitos
  • Hyytiälän metsäasema
  • Värriön tutkimusasema
  • Taloustieteen laitos

• Aleksanteri-instituutti
• Avoin yliopisto
• Biotekniikan instituutti
• Fysiikan tutkimuslaitos (HIP)
• Helsingin taloustieteellinen tutkimuskeskus (HECER)
• Helsingin yliopiston kirjasto
• IPR University Center
• Kansalliskirjasto
• Kielikeskus
• Koulutus- ja kehittämiskeskus Palmenia
• Luonnontieteellinen keskusmuseo
• Geologian museo, Mineraalikabinetti
• Eläinmuseo
• Kasvimuseo
• Kaisaniemen kasvitieteellinen puutarha
• Kumpulan kasvitieteellinen puutarha
• Neurotieteen tutkimuskeskus
• Ruralia-instituutti (Mikkeli)
• Ruralia-instituutti (Seinäjoki)
• Suomen molekyylilääketieteen instituutti (FIMM)
• Tietotekniikan tutkimuslaitos (HIIT)
• Tietotekniikkakeskus
• Tila- ja kiinteistökeskus
• Tutkijakollegium

• Keskustakampus
• Kumpulan kampus
• Meilahden kampus
• Viikin kampus